Стоматологическая поликлиника была открыта в 1976 году в Орджоникидзевском районе г.Магнитогорска Челябинской области для стоматологического обслуживания быстрорастущей южной части города. Основателем поликлиники и её главным врачом до 2002 года являлся Бабошко Алексей Павлович.

Приказом Городского отдела здравоохранения г. Магнитогорска от 07.10.1996 года № 176 Стоматологическая поликлиника получила название Муниципального учреждения здравоохранения «Стоматологическая поликлиника № 3».
С 2002 по 2009 год МУЗ «Стоматологическая поликлиника № 3» руководила Яковлева Елена Владимировна.
С 2009 года по настоящее время стоматологическую поликлинику возглавляет главный врач Спеко Мария Александровна.

В соответствии с постановлением Правительства Челябинской области от 23.05.2018 года № 222-П «О принятии в государственную собственность Челябинской области муниципальных учреждений здравоохранения Магнитогорского городского округа Челябинской области» Муниципальное учреждение здравоохранения «Стоматологическая поликлиника № 3» принято в государственную собственность Челябинской области и переименовано в Государственное бюджетное учреждение здравоохранения «Стоматологическая поликлиника № 1 г. Магнитогорск» (ГБУЗ «Стоматологическая поликлиника № 1 г. Магнитогорск»).

Поликлиника имеет лицензию на все виды стоматологической деятельности. В составе поликлиники в две смены работают 3 хирургических кабинета с операционной, 9 терапевтических кабинетов, 2 ортопедических кабинета, парадонтологический кабинет, рентгенологический и физиотерапевтический кабинеты, зуботехническая лаборатория и ЦСО.

В поликлинике функционирует единственный в городе Магнитогорске кабинет хирургической стоматологии, оказывающий помощь в вечернее и ночное время, в котором опытные врачи-стоматологи-хирурги оказывают помощь жителям города и близлежащих районов.

Поликлиника оказывает платную и бесплатную стоматологическую помощь в рамках программы обязательного медицинского страхования, а так же по полисам добровольного медицинского страхования.

В 2003 году был открыт кабинет платной стоматологической помощи, где оказывают все виды стоматологических услуг.

С 2015 года учреждение оказывает стоматологическую медицинскую помощь (стоматология ортопедическая и иные медицинские услуги) отдельным категориям граждан, уволенным с военной службы, по государственным контрактам за счет средств Министерства обороны Российской Федерации.

С 2015 года поликлиника оказывает все виды медицинской стоматологической помощи за счет средств (части средств) областного материнского (семейного) капитала гражданам, в семьях которых размер среднедушевого дохода не превышает величину прожиточного минимума на душу населения.

Все специалисты, работающие в поликлинике, имеют сертификат или свидетельство об аккредитации специалиста, постоянно совершенствуют свои профессиональные знания и навыки путем обучения по дополнительным профессиональным программам в образовательных и научных организациях.

Зубными врачами и врачами-стоматологами освоены и внедрены в практику современные методы эстетической реставрации зубов, современные анестетики, щадящие методики оперативных вмешательств, имплантация, металлокерамические зубные протезы и многое другое.
Поликлиника оснащена современными стоматологическими оборудованием, инструментами и материалами.

За годы работы поликлиники сложился работоспособный, высокопрофессиональный коллектив, решающий на современном уровне новые задачи по оказанию специализированной стоматологической помощи жителям города Магнитогорска и близлежащих районов.